IEA-samarbeidet styres av Governing board, komitéer og arbeidsgrupper (se figur nedenfor). Det er etablert et sekretariat i Paris. Sekretariatet produserer en rekke rapporter og analyser, og arrangerer/samordner konferanser.
En viktig del av IEA-samarbeidet retter seg mot forskning og teknologiutvikling gjennom selvstendige program, såkalte "Technology Collaboration Programs (TCP)". Norge deltar i flere av disse programmene. Les om den norske deltagelsen her.